公司搬迁时，员工不跟过去，公司应支付经济补偿金。根据《劳动合同法》，单位需按员工工作年限支付补偿，未及时处理可能导致法律纠纷和额外赔偿。
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公司搬迁需付补偿。操作：1. 确认工作年限，计算补偿金；2. 与公司协商补偿事宜；3. 协商不成，准备证据申请劳动仲裁；4. 必要时，诉诸法院。
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公司搬迁补偿款处理方式通常包括协商和仲裁。首先尝试与公司协商达成补偿协议；若协商无果，可申请劳动仲裁来维护权益。