合同工资低于实际工资不一定违法，需看具体情况。依据《劳动法》，若公司无故克扣工资，则违法，劳动者可向劳动行政部门举报或申请支付令。长期不处理，劳动者权益将受损，可能面临工资被持续克扣的风险。
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合同工资与实际工资不符，处理方式有举报、申请支付令或协商变更合同。选择时，应先尝试与公司协商；协商无果，再向劳动行政部门举报或向法院申请支付令。
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合同工资低实际工资，处理如下：1. 若公司无故降低，先与公司沟通，要求解释或补足；2. 沟通无果，收集证据，如工资条、合同等，向劳动行政部门举报；3. 或直接向法院申请支付令，要求公司支付差额；4. 若合同有变动约定，与公司协商变更或重签合同。