司法鉴定费用通常自行承担，但特定情况下机构承担。《司法鉴定程序通则》规定了费用承担原则，若机构擅自邀请专家，费用由其承担。不及时处理费用问题，可能影响鉴定进程及结果有效性。
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司法鉴定费用处理有自行承担和机构承担两种。若鉴定为单方邀请且未经同意，费用由机构承担；其他情况一般由申请鉴定者承担，需根据具体情况选择合适方式。
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司法鉴定费用处理：1.自行承担：一般情况下，司法申请鉴定者需自行支付费用。2.机构承担：若司法鉴定机构擅自邀请专家或出具意见，未经委托人同意，费用由其承担。需根据是否经过同意及邀请方式判断处理方式。